| 年份 | 校级及以上集体奖励 |
| 2023年 | 南京大学本科招生工作先进集体——物理学院 |
| 南京大学研究生招生工作先进集体——物理学院 | |
| 南京大学就业工作先进集体——物理学院 | |
| 南京大学志愿服务先进集体——共青团南京大学物理学院委员会 | |
| 南京大学社会实践优秀组织——共青团南京大学物理学院委员会 | |
南京大学青年五四奖章（集体）——南京大学物理与类脑智能交叉创新团队 | |
南京大学五四红旗团支部3个——本科生2020级团总支、研究生声学一支部、研究生物理二支部 | |
| 南京大学优秀志愿服务项目——“朋辈讲堂”系列互助活动 | |
南京大学社会实践优秀团队3个——“强国”宣讲团、大学生物理创新学习调研团队、南京大学物理学院社会实践团队 | |
南京大学社会实践优秀调研报告——《大学生物理创新学习现状调研分析》 | |
| 南京大学“循红色足迹过十一”主题教育先进集体——物理学院学生会 | |
| 南京大学心理健康优秀品牌活动三等奖——心灵下午茶系列活动 | |
| 南京大学 “全心权益”十佳品牌项目——支点学社“朋辈讲堂”系列互助活动 |
| 年份 | 校级及以上集体奖励 |
| 2022年 | 南京大学五四红旗团委——团委 |
| 南京大学五四青年奖章（集体）——生物医学超声团队 | |
| 南京大学五四红旗团支部——研究生光电三支部 | |
| 南京大学社会实践优秀组织奖——团委 | |
| 南京大学社会实践优秀团队2个——就业实践团队、中学生物理创新学习现状调研团队 | |
| 南京大学志愿服务先进集体——青协 | |
| 南京大学十佳志愿服务项目——星空下的守望者 | |
| 南京大学优秀志愿服务项目——爱心书屋图书传递活动 | |
| 南京大学研究生示范党支部“领航计划”——光电系研究生第三党支部 | |
| 2022年南京大学乒乓球院系杯冠军 | |
| 2021年 | 南京大学2021年“读懂中国”活动——关工委 |
| 南京大学社会实践优秀组织奖——团委 | |
| 南京大学社会实践十佳团队——星空下的守望者 | |
| 南京大学社会实践优秀团队——错位资源追踪小队、漫游鲸 | |
| 南京大学志愿服务先进集体——青协 | |
| 南京大学十佳志愿服务项目——星空下的守望者 | |
| 南京大学优秀志愿服务项目——系图开放自习和爱心书屋书籍传递 | |
| 南京大学基层研究生会十佳品牌工作——第七届五校联盟博士生学术论坛 | |
| 南京大学首届山地越野接力赛——团体第一名、男子第一名 | |
| 南京大学2020-2021年度羽毛球院系杯（乙组）冠军 | |
| 南京大学2020-2021年度乒乓球院系杯总冠军 | |
| 南京大学男足联赛杯冠军 | |
| 南京大学首届青春活力大赛（啦啦操）第八名，最炫服装奖 | |
| 南京大学暖冬校园心理短视频大赛优秀奖2个——心理健康工作室 | |
| 2020年 | 江苏省千优活力团支部（本科2018级5班团支部） |
| 南京大学五四红旗团支部（本科2018级团总支） | |
| “心有所信，方能行远”主题班会最佳创意奖（2018级） | |
| 南京大学第六十一届运动会 团体第二名、男子团体第三名、女子团体第四名 | |
| 南京大学社会实践优秀团队2个——星空下的守望者、迷碟香调查小组 | |
| 南京大学社会实践优秀报告奖——《实体唱片店的发展历程与生存现状调研——基于成都市的实践研究》 | |
| 南京大学志愿服务先进集体——青协 | |
| 南京大学十佳志愿服务项目——星空下的守望者 | |
| 南京大学优秀志愿服务项目——系图开放自习和爱心书屋书籍传递 | |
| 2019年 | 南京大学第60届运动会 男子团体第一名，男女团体第二名 |
| 南京大学2018年度“最佳党日活动”——“探访红色记忆，追寻革命初心”（研究生物理系第二党支部、本科生党支部） | |
| 南京大学“五四红旗团支部”（2017级团总支） | |
| 南京大学示范性团日活动——“知名教授进支部”（2016级团总支） | |
| 南京大学研究生团支部建设示范点——2018级研究生团支部 | |
| 南京大学2018年社会实践优秀团队——星空下的守望者 | |
| 南京大学十佳志愿服务项目——青协“陪伴AS儿童” | |
| 2018年 | 江苏省五四红旗团支部 2016级 |
| 江苏省活力团支部 2016级 | |
| 江苏省先进班集体 2016级 | |
| 南京大学学生工作先进集体 学工办 | |
| 南京大学真理团支部 2014级 | |
| 南京大学五四红旗团支部 2014级、2015级一班、2016级三班 | |
| 南京大学第59届运动会 男女团体第五名 男子团体第三名 | |
| 2017年 | 江苏省先进班集体——2014级一班 |
| 江苏省志愿服务交流展示会优秀志愿服务项目——青协“星星的守望者”陪伴AS儿童志愿活动 | |
| 南京大学五四红旗团总支2个——2015、2016级团总支 | |
| 南京大学优良班风建设示范点——2016级 | |
| 南京大学活力团支部——2016级团总支 | |
| 南京大学优秀主题团日4个——2015级团总支“不忘初心，铸就灿烂辉煌”、2016级团总支“铭刻历史，珍爱和平”、“团聚你我，物动青春”、“新生训练营” | |
| 南京大学志愿服务先进集体——青协 | |
| 南京大学十佳志愿服务项目——青协“陪伴AS儿童项目” | |
| 南京大学优秀志愿服务项目——青协“科普进校园” | |
| 南京大学院系杯辩论赛亚军——辩论队 | |
| 南京大学第五十八届运动会——体育道德风尚奖、男子团体第四、男女团体第七 | |
| 2016年 | 江苏省先进班集体——2014级 |
| 南京大学优良班风建设示范点2个——2014、2015级 | |
| 南京大学“心存伟大，铸就灿烂初心”主题班会优胜奖2个——2014级一班、2015级一班 | |
| 南京大学共青团工作创新奖二等奖（主题活动类）——2015级团总支“恩师访谈” | |
| 南京大学秋季院系杯总冠军——女篮 | |
| 南京大学“我最喜爱的院系迎新晚会”三等奖、最佳人气奖——Alice in Quantumland | |
| 南京大学第五十七届运动会——男子团体第六名 | |
| 南京大学优秀主题团日——2014级“感受科研，预见未来” | |
| 2013年 | 南京大学五四红旗团委 |
| 2012年 | 江苏省先进班集体——2010级物理 |
| 省红十字“博爱青春”优秀项目奖——“加油，少年”暑期实践团 | |
| 南京大学最佳党日——“传播科学火种，点亮智慧人生”（2011、2012党支部） | |
| 南京大学五四红旗团支部标兵——2010物理本团支部 | |
| 南京大学五四红旗团支部——2011级研究生团支部 | |
| 南京大学暑期社会实践十佳团队——“悟理长安”团队 | |
| 南京大学第五十四届运动会——团体第三名 | |
| 2011年 | 江苏省先进班集体——2009级物理 |
| 江苏省最佳党日——“物动青春，红满遵义”（2010、2011党支部） | |
| 南京大学优秀学生工作办公室 | |
| 南京大学优秀招生单位 | |
| 南京大学暑期社会实践优秀集体 | |
| 南京大学十佳社团——“支点” | |
| 南京大学优秀主题教育活动特等奖——2010级“我的青春•我的路” | |
| 2010年 | 江苏省先进班集体——2008级物理 |
| 团中央青苹果计划——物理学院大学生暑期社会实践团“轻舟” | |
| 南京大学先进团支部——2008级本科生5班团支部 | |
| 南京大学暑期社会实践优秀集体 | |
| 南京大学优秀招生单位 | |
| 优秀组织奖——南京大学仙林校区宿舍评比 | |
| 2009年 | 江苏省先进班集体——2007级物理 |
| 江苏省优秀党日——“庆祝建国六十周年主题活动”（2008、2009党支部） | |
| 南京大学学生教育管理创新奖——优秀奖 | |
| 南京大学五四红旗团委 | |
| 南京大学先进团支部——物理系07级2班团支部 | |
| 南京大学先进团支部——物理系08级2班团支部 |
